| 1591 | Se inicia la construcción de la casa, colegio y capilla. |
| 1600-1660 | Construcción del templo principal. |
| 1665 | Construcción de La Capilla de la Virgen de Loreto. |
| 1767-1792 | Expulsión de los jesuitas de la Nueva España. |
| 1793-1826 | El conjunto arquitectónico se asigna como sede de la Real y Literaria Universidad de Guadalajara. |
| 1827-1853 | Palacio Legislativo. Se derriban las torres. Se agrega pórtico neoclásico. |
| 1828-1833 | Escuela Normal Lancasteriana (Capilla de Loreto). |
| 1836-1875 | Escuela Municipal (Capilla de Loreto). |
| 1853-1913 | Culto. |
| 1875-1884 | Terremoto (1875). Trabajos de restauración (1875-1884). |
| 1914-1915 | Cuartel revolucionario. Saqueo. |
| 1925 | Reapertura
de la Universidad. Primer Rector: Enrique Díaz de León. Gobernador: José Guadalupe Zuno. |
| 1925-1926 | Inicio
de las pinturas murales. David Alfaro Siqueiros y Amado de la Cueva. |
| 1930-1933 | Realización de los murales del "Olimpus house". |
| 1919-1948 | Dirección General de Estudios Superiores y Oficina de la Benemérita Sociedad de Geografía y Estadística. |
| 1937-1938 | Puesta
a la venta del edificio del colegio, anexo al templo (hoy edificio Lutecia). Gobernador: Everardo Topete. |
| 1948-1985 | Oficinas de Telégrafos. |
| 1985 | 2 de febrero. Los gobiernos Federal y Estatal otorgan la custodia del edificio a la Universidad de Guadalajara. |
| 1986-1991 | Desocupado. Trabajos de adecuación para la Biblioteca Iberoamericana "Octavio Paz". En 1986 se conformó la Comisión de restauración del ex templo de Santo Tomás de Aquino. |
| 1991 | 19 de julio. Inauguración de la Biblioteca Iberoamericana "Octavio Paz". |
| 1995 | Inauguración del Fondo Edmundo Valadés (Capilla de Loreto). |